Esto que parece muy sencillo, puede llevar muchos quebraderos de cabeza.

Bien!! Empecemos!!!

Tenemos nuestro .jnlp desplegado en el lugar donde lo hemos instalado.
Las palabras mágicas para que se actualice es poner :

<shortcut online="false">
          <desktop/>
          <menu submenu="AsisT"/>
        </shortcut>
&nbsp;

De esta forma cuando se haga dobleclik en el icono del escritorio, se actualizarán los cambios del jnlp.

Para entenderlo mejor, adjunto la estructura del jnlp.

<jnlp spec="1.5+" codebase="http://192.168.X.X/" href="http://192.168.X.X/eljnlp.jnlp>

 <information>
        <title>AsisT - DEMO</title>
        <vendor>Ibernex SL</vendor>
        <icon href="images/icono.png"/>
        <shortcut online="false">
          <desktop/>
          <menu submenu="AsisT"/>
        </shortcut>
    </information>
 <security>
      <all-permissions/>
    </security>
  <resources>
...
  </resources>
</jnlp>